[EDIT retirando codigo de pruebas]

src/salidasautomaticas/main/Main.java

@@ -24,7 +24,7 @@ public class Main {
 //        setLogLevel(Level.INFO);//PRODUCCION    
         log.info("Inicializando programa [Salidas Automaticas]...");
   
-        Date horaInicio = Metodos.getHoraEjecucion("11:30");
+        Date horaInicio = Metodos.getHoraEjecucion("12:30");
         int periodo = 86400000;//El codigo se ejecutará cada 24h, 86400000 representa 24h en milisegundos
         
         TimerTask task = new ProgramarSalidasTask();

src/salidasautomaticas/mysqldao/MysqlDAOFactory.java

@@ -16,38 +16,35 @@ import salidasautomaticas.dao.SalidasDAO;
  */
 public class MysqlDAOFactory extends DAOFactory {
 
-    static {
-        try {
-            Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver");
-        } catch (Exception e) {
-            // TODO Auto-generated catch block
-            e.printStackTrace();
-        }
-    }
-
-    public static Connection obtenerConexion(String base) {
-        Connection conexion = null;
-        if (base.equals("nuevo")) {
-            try {
-//                conexion = DriverManager.getConnection(
-//                        "jdbc:mysql://172.16.2.39:3306/nuevo",
-//                        "melani",
-//                        "melani");
-                conexion = DriverManager.getConnection(
-                        "jdbc:mysql://172.16.2.39:3306/nuevo",
-                        "melani",
-                        "melani");
-
-            } catch (Exception e) {
-                e.printStackTrace();
-            }
-        }
-        return conexion;
-    }
-
-    @Override
-    public SalidasDAO getSalidasDAO() {
-        return new SalidasMysqlDAO();
-    }
+	static {
+		try {
+			Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver");
+		} catch (Exception e) {
+			// TODO Auto-generated catch block
+			e.printStackTrace();
+		}
+	}
+
+	public static Connection obtenerConexion(String base) {
+		Connection conexion = null;
+		if (base.equals("nuevo")) {
+			try {
+				String url = "jdbc:mysql://172.16.2.43:3306/nuevo";
+				String username = "billy";
+				String password = "billy";
+
+				conexion = DriverManager.getConnection(url, username, password);
+
+			} catch (Exception e) {
+				e.printStackTrace();
+			}
+		}
+		return conexion;
+	}
+
+	@Override
+	public SalidasDAO getSalidasDAO() {
+		return new SalidasMysqlDAO();
+	}
 
 }

src/salidasautomaticas/mysqldao/SalidasMysqlDAO.java

@@ -6,6 +6,8 @@
 package salidasautomaticas.mysqldao;
 
 import java.sql.Connection;
+import java.time.Duration;
+import java.time.Instant;
 import java.time.LocalDate;
 import java.util.Iterator;
 import java.util.logging.Level;
@@ -46,7 +48,7 @@ public class SalidasMysqlDAO implements SalidasDAO {
                 + "estado in (1, 2, 5) "//Que sean asistencias 1=Asistio, 2=No marco y 5=Tardanza
                 + "AND p.codtipo!=3 "//Que registren asistencia
                 + "AND a.fecha_asis=? "
-//                + "AND p.retirado = 0 "
+                + "AND p.retirado = 0 "
 //                + "AND p.horaing = su.horaLV "
 //                + "AND p.mining = su.minutoLV "
 //                + "AND p.horaingsabado = su.sabadoLV "
@@ -54,7 +56,7 @@ public class SalidasMysqlDAO implements SalidasDAO {
                 + "AND NOT p.codlocal IN ('L035', 'L053', 'L038') "//Que no sea profesores por horas, pronoe belisario y grupo MH
                 + "AND NOT p.pronoe = 1 "//Que no sea pronoe
                 + "AND NOT p.codcargo IN (71, 13, 96, 41) "//Que no sea policia ni de cafeteria ni vigilante ni interna psicologa
-//                + "AND p.tmp_id not in (99998, 9998, 99999, 9888) "//Que esten en planilla
+                + "AND p.tmp_id not in (99998, 9998, 99999, 9888) "//Que esten en planilla
                 + "AND NOT p.horaing > 19 "
                 + "AND NOT p.salidaS = '') as tabla WHERE NULLIF( {campo_salida} , '') is NOT null  GROUP BY {campo_salida} ";
 
@@ -110,7 +112,7 @@ public class SalidasMysqlDAO implements SalidasDAO {
     public JSONArray obtenerAsistencias(String horaProgramada) throws Exception {
         Connection cn = MysqlDAOFactory.obtenerConexion("nuevo");
 
-        String fechaPartida = "2018-03-01";
+        String fechaPartida = "2018-01-01";
 
         String query = "SELECT * from "
                 + "(select "
@@ -132,10 +134,9 @@ public class SalidasMysqlDAO implements SalidasDAO {
                 + "AND (WEEKDAY(asistencia.fecha_asis) + 1) !=7 " //Que no sea domingo
                 + "AND NOT ( (WEEKDAY(asistencia.fecha_asis) + 1)=6 and personal.codcargo in ({cod_cargo_primaria})  ) " //Que no sean de primaria los sabados
                 + "AND asistencia.estado in (1, 2, 5) "//Que sean asistio, tardanza y no marco
-//                + "AND personal.tmp_id not in (99998, 9998, 99999, 9888) "//Que esten en planilla
+                + "AND personal.tmp_id not in (99998, 9998, 99999, 9888) "//Que esten en planilla
                 + "AND personal.codtipo!=3 "//Que si registren asistencia
-//                + "AND personal.retirado=0) as tabla "
-                + ") as tabla "
+                + "AND personal.retirado=0) as tabla " //Que no esten retirados
                 + "where tabla.salida!=''";
 
         String campoSalida = "("
@@ -168,8 +169,8 @@ public class SalidasMysqlDAO implements SalidasDAO {
         int aleatorioHora = 0, aleatorioMin = 0;
 
         JSONArray listaAsistencias = obtenerAsistencias(horaSalida);
-        log.info("hora=" +horaSalida+ ", asistencias para actualizar=" + listaAsistencias.length());
-
+        log.info("hora de salida=" +horaSalida+ ", asistencias para actualizar=" + listaAsistencias.length());
+				Instant inicioEjecucion = Instant.now();
 
         int[] updateCounts = new int[listaAsistencias.length()];
         boolean updateAll = false;
@@ -200,9 +201,11 @@ public class SalidasMysqlDAO implements SalidasDAO {
 
             updateCounts[i] = resultado.getInt("msg");
             i++;
-
         }
         
+				Instant finEjecucion = Instant.now();
+				Duration duracionProceso = Duration.between(inicioEjecucion, finEjecucion);
+				log.info("El proceso ha durado " + duracionProceso);
         int cont0=0;
         int cont1 =0;
         
@@ -251,18 +254,4 @@ public class SalidasMysqlDAO implements SalidasDAO {
 
         return aleatorio;
     }
-    
-    
-    public static void main(String[] args) {
-        SalidasMysqlDAO dao = new SalidasMysqlDAO();
-        
-        try {
-            JSONObject a = dao.actualizarSalida("17:30");
-            System.out.println(a);
-//            System.out.println(a.length());
-        } catch (Exception ex) {
-            java.util.logging.Logger.getLogger(SalidasMysqlDAO.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
-        }
-        
-    }
 }
\ No newline at end of file

src/salidasautomaticas/schedule/ProgramarSalidasTask.java

@@ -30,12 +30,7 @@ public class ProgramarSalidasTask extends TimerTask {
     public void run() {
 
         try {
-//            JSONArray listaHorarios = service.obtenerHorariosSalida();
-            JSONArray listaHorarios = new JSONArray();
-            String[] arraySalidas = {"16:13", "14:46", "14:50", "17:00", "17:30", "18:00"};
-            for (String salida : arraySalidas) {
-                listaHorarios.put(new JSONObject().put("salida", salida));
-            }
+            JSONArray listaHorarios = service.obtenerHorariosSalida();
 
             Timer timer;
             TimerTask task;
@@ -56,7 +51,7 @@ public class ProgramarSalidasTask extends TimerTask {
 
                     log.trace("Timer " + timer);
                 } else {
-                    log.trace("Ya pasó la hora");
+                    log.trace("Ya pasó la hora " +horaSalida);
                 }
             }